一种工厂式水稻自动化种植方法，本方法中水稻在种植厂房内完成育种发芽、种植养护和收割，其特征在于，种植厂房为多层式楼房，每层楼房的地板上成排地排列设置有多排种植单元，每个种植单元包括布置在地板上的种植床，还包括设置在种植床上方的照明装置和喷灌装置；水稻育种发芽后种植在种植床内，依靠控制照明装置定时照明，依靠控制喷灌装置定时喷水和施肥，直至稻株成熟后收割。本发明能够实现工厂式水稻种植生产，具有安全无害，生产效率高，占用土地少等优点。